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약국 조제·일반 매출 과면세 분리 정산 및 부가가치세 절세 전략
이민우 대표 공인회계사 · 세무사
정평세무컨설팅 전문 세무 칼럼
2026.08.08
읽는 시간 약 3분
핵심 세무 요약 (Executive Summary)
약국의 핵심 세무 포인트는 조제약(면세)과 일반약(과세)의 정확한 과면세 분리 기장입니다. POS 데이터와 AI 시스템 분석을 결합하여 가공 비율 오류를 예방하고 종합소득세 및 부가가치세 부담을 실질적으로 줄이는 방안을 다룹니다.
약국 세무 관리는 조제약 매출(부가가치세 면세)과 일반 의약품 및 건강기능식품 매출(부가가치세 과세)을 얼마나 정교하게 구분하여 기장하느냐에 따라 성패가 갈립니다.
매출 정산 시 키오스크 및 POS 데이터의 과면세 비율을 정확히 매칭하지 않으면, 부가가치세 매입세액 공제 안분 계산 시 오류가 발생하여 예상치 못한 추징을 당할 수 있습니다. 정평세무컨설팅은 AI/데이터 기반 스마트 세무 시스템을 활용해 결제 유형별 데이터 정산 자동 검증 프로세스를 구축하고 있습니다.
또한 이민우 회계사 1:1 직접 소통을 통해 약국의 의약품 구입 명세서와 심평원 조제 매출 데이터를 상호 검증하며, 사전 합의된 투명한 수수료 체계(기습 조정료 ZERO)를 적용하여 정산 시즌의 불필요한 비용 부담을 없앴습니다. 영세 범위를 넘어서는 특수 케이스 개인사업자는 별도 수임 협의 필수 기준을 적용합니다.